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Exame » SEQUENCIAMENTO/GENOTIPAGEM SARS-CoV2 [711814]

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O teste de sequenciamento de SARS-CoV2 tem como objetivo realizar o sequenciamento completo do vírus, a fim de comparar com todas as outra sequências de SARS-CoV2 que já foram relatadas anteriormente ou que já tenham sido sequenciadas em nosso laboratório, sendo mais adequado para determinar a transmissão de uma cepa de um indivíduo para outro, e, se houve reinfecção ou reativação da infecção. Dessa forma é possível fazer o rastreio epidemiológico da cepa e analisar a presença de mutações que possam implicar em alterações virológicas relevantes.

 

Está indicado para pacientes com PCR positivo (carga viral alta), em que há suspeita de reinfecção ou que estiveram fora do território nacional, não havendo um período específico para ser realizado. Pode ser utilizado também para determinar se existe homologia (semelhança) entre duas cepas de COVID para investigar casos de possíveis origens comuns.

SEQUENCIAMENTO/GENOTIPAGEM SARS-CoV2
Este exame não é vendido online. Para comprá-lo:
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Documentos Obrigatórios

Não há documentos obrigatórios.

Instruções

Exigência Descrição
Materiais
  • Swab de rayon ou FLOQswab
Conservantes
  • Salina estéril
Volume Recomendável
  • 2 Swabs das nasofaringes (1 em cada narina) em tubo estéril (tipo Falcon) contendo 3 mL de salina 0,9%
Tempo de Jejum
  • Jejum não obrigatório
Conservação
  • Até 48h refrigerado (2 à 8°C)
  • Até 30 dias congelado (-10°C à -30°C)
Critérios de Rejeição
  • Swabs ressecados.
  • Uso de conservante, que não salina estéril.
  • Coleta em swab de algodão ou contendo alginato de cálcio.
  • Acondicionamento incorreto da amostra.

  • Amostras de swab em tubo não estéril ou sem vedação

Critérios de Restrição
  • Pedido médico incompleto ou sem dados.
Orientações para coleta e envio de amostras

Swab nasofaringe

  • Utilizar face-shield ou óculos de segurança, máscara N95, luvas, touca e jaleco descartável durante a coleta. Seguir as orientações de segurança da ANVISA e MS.
  • Introduzir delicadamente o swab em uma das narinas até encontrar resistência na parede posterior da nasofaringe realizando movimentos rotatórios e depois repetir o processo na outra narina utilizando outro swab.
  • Colocar os swabs no mesmo tubo contendo salina estéril 0,9% e identifica-lo corretamente.
  • A identificação do tubo deve conter: nome completo do paciente, data de nascimento, data e hora da coleta.
  • Não aliquotar.
  • Enviar os tubos primários sem manipulação nas temperaturas indicadas.

Recebimento de amostras já coletadas devem ser pré-agendadas com nosso atendimento.

Metodologia

A metodologia usada no exame é Sequenciamento de Nova Geração (NGS).

O teste identifica o material genético de uma patógeno viral por técnicas de sequenciamento de nova geração sem a utilização de primers específicos. Na prática, isto significa que o RNA (cDNA) de todos os organismos em uma amostra serão sequenciados. Em seguida, os dados de sequenciamento gerados são analisados e comparados com bancos de dados públicos de genomas virais por ferramentas de bioinformática para a identificação e confirmação do patógeno viral. A identificação das sequências de um determinado patógeno viral após as etapas de confirmação é precisa e inequívoca, descartada a presença de contaminantes. Vale ressaltar que a técnica foi validada somente para vírus com o genoma de RNA.

Limitações do exame

O exame só pode ser realizado em amostras com carga viral media/alta (Ct inferior a 30). Caso o paciente não tenha carga viral suficiente, o exame será cancelado.

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