Neste exame é realizado o sequenciamento e avaliação do número de cópias do gene MUTYH.
A polipose adenomatosa familiar (FAP) é uma doença autossômica dominante caracterizada pelo desenvolvimento de numerosos pólipos adenomatosos e um grande risco para o surgimento de tumores colorretais. Existem a forma clássica autossômica dominante e a forma autossômica recessiva (mais branda).
Um tipo mais brando de polipose adenomatosa familiar, chamada polipose adenomatosa familiar autossômica recessiva, também foi identificado. Pessoas com o tipo autossômica recessiva desta doença têm menos pólipos do que aqueles com o tipo clássico. Menos de 100 pólipos geralmente se desenvolvem, ao invés de centenas ou milhares (como na forma clássica). A herança autossômica recessiva desta doença é causada por mutações em um gene diferente do que os tipos clássicos e atenuadas de polipose adenomatosa familiar.
Mutações no gene MUTYH causam essa forma de polipose adenomatosa familiar (também chamado polipose associada à MYH). Mutações nesse gene evitam que as células corrijam os erros que ocorrem durante a replicação do DNA, em preparação para a divisão celular. Como estes erros se acumulam no DNA de uma pessoa, a probabilidade de crescimento excessivo de células aumenta, levando a pólipos do cólon e da possibilidade de câncer de cólon.
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Genes Analisados
Avaliação por sequenciamento e do número de cópias
- MUTYH: Cobertura média esperada de 100%.
Documentos Obrigatórios
Instruções
Exigência | Descrição |
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Materiais |
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Conservantes |
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Volume Recomendável |
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Tempo de Jejum |
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Conservação |
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Critérios de Rejeição |
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Critérios de Restrição |
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Última Atualização |
09/03/2022 |
Documentos Obrigatórios |
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Metodologia
O DNA extraído é submetido a sequenciamento de segunda geração na plataforma Illumina, após enriquecimento por um método de captura. Os dados são processados para chamada de variantes (SNVs, pequenas indels) e análise de número de cópias (CNV) para grandes deleções e duplicações exônicas no Pipeline Genomika-Einstein.
A cobertura média esperada é de acima de 99% das bases com profundidade acima de 30x nos exons e 5pb de região intrônica adjacente, além de outras regiões não-codificantes específicas conhecidamente causadoras de fenótipos clínicos relevantes até o momento do desenho do ensaio. Genes com cobertura inferior a 98% são devidamente informados na seção de genes analisados. A numeração da variante é feita através do transcrito de referência a partir da base A do códon de iniciação ATG alinhado contra o genoma de referência GRCh38/hg38. A classificação de variantes é feita de acordo com os critérios do Colégio Americano de Genômica e Genética Clínica (ACMG).
Limitações do exame
Este teste detecta >99% das variantes SNVs e de pequenas deleções e duplicações com até 20bp. Variantes maiores que 20bp e menores do que um éxon podem ser detectadas com sensibilidade reduzida. Análise de número de cópias (CNV) para variantes de um ou mais exons possui uma sensibilidade de >99%. Variantes podem não ser relatadas caso estejam presentes em regiões gênicas não sequenciadas adequadamente, regiões ricas em repetições, regiões intrônicas profundas e áreas com pseudo-genes.
Outros nomes para SEQUENCIAMENTO DO GENE MUTYH COM CNV
- Gene MUTH
- Polipose Adenomatosa Familiar (FAP)
- Polipose associada à MYH