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Exame » PAINEL GENETICO PARA LEUCEMIA LINFOBLASTICA AGUDA [713611]

O painel de mutações para Leucemia Linfoblástica Aguda (LLA) está baseado no sequenciamento de nova geração incluindo 51 genes (37 genes completos e 14 regiões hotspots) e análise de fusões envolvendo 27 genes de importância clínica na LLA.

São verificadas as seguintes alterações:

- alterações de nucleotídeo único (SNVs)

- pequenas inserções e deleções (INDELS)

- fusões gênicas

O ensaio fornece o perfil de mutações e o percentual de apresentação das variantes na amostra ao diagnóstico e em amostras pós-tratamento. Porém para estas últimas a sensibilidade pode, eventualmente, ser insuficiente.

Lista dos 51 genes avaliados com os respectivos éxons de interesse (para alterações de SNV e INDELS por sequenciamento de DNA):

ABL1 (4-9); AFF1 (completo); ATM (completo); BRAF (6, 11-16, 18); CDKN2A (completo); CDKN2B (completo); CEBPA (completo); CREBBP (completo); CRLF2 (completo); DNMT3A (completo); EPOR (completo); ERG (completo); ETV6 (completo); EZH2 (completo); FAT1 (2‡; 8; 9; 10‡; 13; 16; 21; 22‡; 25‡; 27‡); FAT3 (1‡; 9‡; 10; 11; 15; 18‡; 23‡; 25‡); FBXW7 (9-12); FLT3* (11, 14-21); GATA3 (completo); IDH1 (4); IDH2 (4); IKZF1 (completo); IKZF2 (completo); IKZF3 (completo); IL7R (completo); JAK1 (completo); JAK2 (completo); JAK3 (completo); KRAS (completo); LEF1 (1, 2 e 3); LYL1 (completo); MLLT1 (completo); NOTCH1 (3-6, 8, 10, 13, 15, 17, 18, 20, 25-28, 32-34); NRAS (2 e 3); P2RY8 (completo); PAX5 (completo); PHF6 (completo); PTEN (completo); PTPN11 (1-4, 6-13); RB1 (completo); RUNX1 (completo); SH2B3 (completo); STAT3 (completo); STAT5B (completo); TCF3 (completo); TET2 (1); TLX3 (completo); TP53 (completo); TYK2 (completo); U2AF1 (2, 6, 8); WT1 (completo).

*Variantes do tipo ITD (duplicação interna em tandem) no gene FLT3 são pesquisadas por meio da técnica de eletroforese capilar.

‡ cobertura parcial do exon.

 

Lista dos 27 genes principais para análise de fusões:

ABL1; ABL2; CRLF2; CSF1R; EPOR; ERG; ETV6; FGFR1; FLT3; IKZF1; IKZF2; JAK2; KMT2A; MEF2D; MKL1; MLLT10; NF1; NOTCH1; NUP214; NUTM1; PDGFRA; PDGFRB; RUNX1; SS18; TAL1; TCF3; ZNF384.

As fusões envolvendo os 27 genes principais podem ocorrer com diferentes genes parceiros, totalizando 100 fusões conhecidas (lista abaixo).

Além disso o nosso teste é capaz de detectar fusões envolvendo os 27 genes com novos parceiros.