Alterações do gene PALB2 (partner and localizer of BRCA2) foram identificadas como fator de risco no câncer de mama. Mutações monoalélicas resultam em câncer, enquanto mutações bialélicas levam a anemia de Fanconi. O PALB2 codifica uma proteína que funciona como um supressor tumoral, por ligação com BRCA2 no núcleo celular, participando do mecanismo de reparo do DNA.
Neste teste é realizado o sequenciamento completo do gene PALB2.
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PRAZO PARA RESULTADO APÓS A GENOMIKA RECEBER A COLETA
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Genes Analisados
Documentos Obrigatórios
Instruções
Exigência | Descrição |
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Materiais |
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Conservantes |
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Volume Recomendável |
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Tempo de Jejum |
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Conservação |
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Critérios de Rejeição |
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Critérios de Restrição |
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Última Atualização |
01/12/2021 |
Documentos Obrigatórios |
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Metodologia
O DNA é extraído de sangue periférico ou saliva de forma automatizada (QIASymphony). A técnica principal para o preparo da biblioteca de DNA é utilizando-se a tecnologia de PCR multiplexado com molecular barcode (QiaSeqDNA V3). Caso existam regiões não adequadamente cobertas na primeira técnica, é preparada por PCR convencional seguido de Nextera ou Sanger. O resultado final é uma cobertura de 100% das bases com profundidade acima de 50x nos exons e 5pb de região intrônica adjacente. A chamada de variante é feita através do transcrito de referência a partir da base A do códon de iniciação ATG alinhado contra o genoma de referência GRCh37/hg19.
Limitações do exame
- Este teste detecta pequenas deleções e duplicações até 17 bp, mas grandes deleções e duplicações não são detectadas por esta metodologia. Outras alterações estruturais,como inversões e translocações também não são detectadas. Havendo suspeita de algumas destas alterações, pode-se usar metodologias como array CGH, MLPA, qPCR ou FISH. - Mutações por expansão de repeats de trinucleotídeos não são detectáveis por sequenciamento. - Mutações intrônicas profundas, mitocondriais ou em regiões regulatórias, como promotores, não são detectáveis no presente teste. - Alteração epigenéticas não são detectáveis por este teste.
Outros nomes para SEQUENCIAMENTO DO GENE PALB2
- Anemia de Fanconi
- Câncer de Mama
- Gene PALB2