Este painel avalia variações do número de cópias para identificação de deleções e/ou duplicações nos 20 genes, cujas variações podem estar associadas a cânceres de mama, ovário e útero hereditários.
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COLETA PRESENCIAL
Você tem a opção de ir até uma de nossas unidades pegar seu kit de saliva ou, se necessária, realizar coleta de sangue.
PRAZO PARA RESULTADO APÓS A GENOMIKA RECEBER A COLETA
Entrega em até 28 dias corridos, a partir da data de entrega da coleta.
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Genes Analisados
Avaliação por sequenciamento e do número de cópias
- MLH1: A análise de deleção/duplicação cobre a região promotora do gene.
 - PTEN: A análise de deleção/duplicação cobre a região promotora do gene.
 - PMS2: A análise de deleção/duplicação não é realizada para os exons 1 ao 5, 9 e do 11 ao 15 deste gene.
 - APC: A região 1B e 1A do promotor é coberta pela análise de deleção/duplicação.
 
Pseudogenes
BRCA1: Pseudo-gene no(s) exon(s):2
CHEK2: Pseudo-gene no(s) exon(s):11-15
NF1: Pseudo-gene no(s) exon(s):9-11,13-29,31-35
PMS2: Pseudo-gene no(s) exon(s):1-5,9,11-15
PTEN: Pseudo-gene no(s) exon(s):9
Documentos Obrigatórios
Instruções
| Exigência | Descrição | 
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| Materiais | 
    
 ou 
 ou 
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| Conservantes | 
    
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| Volume Recomendável | 
    
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| Tempo de Jejum | 
    
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| Conservação | 
    
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| Critérios de Rejeição | 
    
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| Critérios de Restrição | 
    
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| Última Atualização | 
     30/10/2019  | 
  
| Documentos Obrigatórios | 
          
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Metodologia
O DNA extraído é submetido a sequenciamento de segunda geração na plataforma Illumina, após enriquecimento por um método de captura. Os dados são processados para chamada de variantes (SNVs, pequenas indels) e análise de número de cópias (CNV) para grandes deleções e duplicações exônicas no Pipeline Genomika-Einstein.
A cobertura média esperada é de acima de 99% das bases com profundidade acima de 30x nos exons e 5pb de região intrônica adjacente, além de outras regiões não-codificantes específicas conhecidamente causadoras de fenótipos clínicos relevantes até o momento do desenho do ensaio. Genes com cobertura inferior a 98% são devidamente informados na seção de genes analisados. A numeração da variante é feita através do transcrito de referência a partir da base A do códon de iniciação ATG alinhado contra o genoma de referência GRCh38/hg38. A classificação de variantes é feita de acordo com os critérios do Colégio Americano de Genômica e Genética Clínica (ACMG).
Limitações do exame
Este teste detecta >99% das variantes SNVs e de pequenas deleções e duplicações com até 20bp. Variantes maiores que 20bp e menores do que um éxon podem ser detectadas com sensibilidade reduzida. Análise de número de cópias (CNV) para variantes de um ou mais exons possui uma sensibilidade de >99%. Variantes podem não ser relatadas caso estejam presentes em regiões gênicas não sequenciadas adequadamente, regiões ricas em repetições, regiões intrônicas profundas e áreas com pseudo-genes.
Outros nomes para NÚMERO DE CÓPIAS PAINEL MAMA POR NGS
- ATM
 - BRIP1
 - CDH1
 - EPCAM
 - GENE APC
 - Gene CDH1
 - genes BRCA1 e BRCA2
 - MLH1
 - MSH2
 - MSH6
 - NBN
 - NF1
 - PALB2
 - PMS2
 - PTEN
 - RAD51C
 - RAD51D
 - STK11
 - TP53
 


