Este painel avalia variações do número de cópias para identificação de deleções e/ou duplicações nos 20 genes, cujas variações podem estar associadas a cânceres de mama, ovário e útero hereditários.
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ENTREGA DO KIT ATÉ VOCÊ
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COLETA PRESENCIAL
Você tem a opção de ir até uma de nossas unidades pegar seu kit de saliva ou, se necessária, realizar coleta de sangue.
PRAZO PARA RESULTADO APÓS A GENOMIKA RECEBER A COLETA
Entrega em até 28 dias corridos, a partir da data de entrega da coleta.
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Inicialmente enviaremos para você o kit de coleta.
Você coleta sua amostra de DNA e envia de volta sem custo adicional.
O prazo para seu resultado começa a ser contado quando recebemos o kit em nosso laboratório.
Genes Analisados
Avaliação por sequenciamento e do número de cópias
- MLH1: A análise de deleção/duplicação cobre a região promotora do gene.
- PTEN: A análise de deleção/duplicação cobre a região promotora do gene.
- PMS2: A análise de deleção/duplicação não é realizada para os exons 1 ao 5, 9 e do 11 ao 15 deste gene.
- APC: A região 1B e 1A do promotor é coberta pela análise de deleção/duplicação.
Pseudogenes
BRCA1: Pseudo-gene no(s) exon(s):2
CHEK2: Pseudo-gene no(s) exon(s):11-15
NF1: Pseudo-gene no(s) exon(s):9-11,13-29,31-35
PMS2: Pseudo-gene no(s) exon(s):1-5,9,11-15
PTEN: Pseudo-gene no(s) exon(s):9
Documentos Obrigatórios
Instruções
Exigência | Descrição |
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Materiais |
ou
ou
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Conservantes |
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Volume Recomendável |
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Tempo de Jejum |
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Conservação |
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Critérios de Rejeição |
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Critérios de Restrição |
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Última Atualização |
30/10/2019 |
Documentos Obrigatórios |
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Metodologia
O DNA extraído é submetido a sequenciamento de segunda geração na plataforma Illumina, após enriquecimento por um método de captura. Os dados são processados para chamada de variantes (SNVs, pequenas indels) e análise de número de cópias (CNV) para grandes deleções e duplicações exônicas no Pipeline Genomika-Einstein.
A cobertura média esperada é de acima de 99% das bases com profundidade acima de 30x nos exons e 5pb de região intrônica adjacente, além de outras regiões não-codificantes específicas conhecidamente causadoras de fenótipos clínicos relevantes até o momento do desenho do ensaio. Genes com cobertura inferior a 98% são devidamente informados na seção de genes analisados. A numeração da variante é feita através do transcrito de referência a partir da base A do códon de iniciação ATG alinhado contra o genoma de referência GRCh38/hg38. A classificação de variantes é feita de acordo com os critérios do Colégio Americano de Genômica e Genética Clínica (ACMG).
Limitações do exame
Este teste detecta >99% das variantes SNVs e de pequenas deleções e duplicações com até 20bp. Variantes maiores que 20bp e menores do que um éxon podem ser detectadas com sensibilidade reduzida. Análise de número de cópias (CNV) para variantes de um ou mais exons possui uma sensibilidade de >99%. Variantes podem não ser relatadas caso estejam presentes em regiões gênicas não sequenciadas adequadamente, regiões ricas em repetições, regiões intrônicas profundas e áreas com pseudo-genes.
Outros nomes para NÚMERO DE CÓPIAS PAINEL MAMA POR NGS
- ATM
- BRIP1
- CDH1
- EPCAM
- GENE APC
- Gene CDH1
- genes BRCA1 e BRCA2
- MLH1
- MSH2
- MSH6
- NBN
- NF1
- PALB2
- PMS2
- PTEN
- RAD51C
- RAD51D
- STK11
- TP53