Neste exame é realizado o sequenciamento e avaliação do número de cópias do gene MEFV.
O sequenciamento completo do gene MEFV pode detectar mutações que podem estar associadas à Febre Mediterrânea Familiar. A Febre Mediterrânea Familiar (FMF) é um distúrbio genético autossômico recessivo caracterizado por curtos surtos recorrentes de febre, acompanhados de dor abdominal, dot torácica, dor articular e um eritema semelhante à erisipela. Tipicamente, esses episódios duram de 12 a 72h e podem variar na severidade. As doze mutações mais comuns relatadas como causadoras de FMF e um polimorfismo/ mutação são responsáveis por aproximadamente 85% dos alelos anormais em populações de armênios, judeus sefardim, árabes, ou turcos.
A FMF afeta primariamente populações originárias da região mediterrânea, principalmente pessoas com descendência armena, arabe, turca e judia.
Mutações no gene MEFV causam a Febre Mediterrânea familiar. Esse gene codifica a proteina pirina (também conhecida como marenostrina), a qual esta envolvida com o sistema imune, auxiliando no processo de inflamação. Mutações nesse gene reduzem a atividade da pirina, o que prejudica o controle do processo inflamatório, o qual pode lesar tecidos e órgãos quando inapropriado ou prolongado.
A análise do DNA é recomendada para pacientes que apresentam sinais ou sintomas sugestivos deste distúrbio para confirmar o diagnóstico clínico. A análise direta do gene da doença de FMF também está recomendada para a triagem de portador de casais em que pelo menos uma das pessoas está em alto risco. O sequenciamento dos exons 2, 3, 5 e 10 do gene da FMF está disponível e detecta uma estimativa de 97% de todas as mutações conhecidas.
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Genes Analisados
Avaliação por sequenciamento e do número de cópias
- MEFV: Cobertura média esperada de 100%.
Documentos Obrigatórios
Instruções
Exigência | Descrição |
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Materiais |
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Conservantes |
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Volume Recomendável |
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Tempo de Jejum |
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Conservação |
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Critérios de Rejeição |
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Critérios de Restrição |
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Última Atualização |
09/03/2022 |
Documentos Obrigatórios |
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Metodologia
O DNA extraído é submetido a sequenciamento de segunda geração na plataforma Illumina, após enriquecimento por um método de captura. Os dados são processados para chamada de variantes (SNVs, pequenas indels) e análise de número de cópias (CNV) para grandes deleções e duplicações exônicas no Pipeline Genomika-Einstein.
A cobertura média esperada é de acima de 99% das bases com profundidade acima de 10x nos exons e 5pb de região intrônica adjacente, além de outras regiões não-codificantes específicas conhecidamente causadoras de fenótipos clínicos relevantes até o momento do desenho do ensaio. Genes com cobertura inferior a 98% são devidamente informados na seção de genes analisados. A numeração da variante é feita através do transcrito de referência a partir da base A do códon de iniciação ATG alinhado contra o genoma de referência GRCh38/hg38. A classificação de variantes é feita de acordo com os critérios do Colégio Americano de Genômica e Genética Clínica (ACMG).
Limitações do exame
Este teste detecta >99% das variantes SNVs e de pequenas deleções e duplicações com até 20bp. Variantes maiores que 20bp e menores do que um éxon podem ser detectadas com sensibilidade reduzida. Análise de número de cópias (CNV) para variantes de um ou mais exons possui uma sensibilidade de >99%. Variantes podem não ser relatadas caso estejam presentes em regiões gênicas não sequenciadas adequadamente, regiões ricas em repetições, regiões intrônicas profundas e áreas com pseudo-genes.
Outros nomes para SEQUENCIAMENTO DO GENE MEFV COM CNV
- AIS
- Febre Familiar do Mediterrâneo
- FMF
- Gene MEFV
- síndromes Auto-Inflamatórias