Este teste sequencia todos os exons e splice sites dos genes BRCA1 e BRCA2. Mutações nesses genes supressores tumorais estão relacionadas com risco aumentado para desenvolvimento de câncer de mama e câncer de ovário. A identificação dos portadores desse risco genético permite o desenvolvimento de um plano de prevenção personalizado, diferente da população geral. Esse teste não avalia grandes deleções e duplicações nesses dois genes. Essa análise pode ser feito no teste BRCATotal, ou solicitando-se o teste de MLPA desses genes, separadamente.
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Genes Analisados
- BRCA2: É realizada a PCR seguida de eletroforese em gel de agarose do exon 3 de BRCA2 para pesquisa da inserção ALU.
Pseudogenes
BRCA1: Pseudo-gene no(s) exon(s):2
Documentos Obrigatórios
Instruções
Exigência | Descrição |
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Materiais |
ou
ou
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Conservantes |
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Volume Recomendável |
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Tempo de Jejum |
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Conservação |
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Critérios de Rejeição |
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Critérios de Restrição |
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Última Atualização |
04/11/2019 |
Documentos Obrigatórios |
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Metodologia
O DNA é extraído de sangue periférico ou saliva de forma automatizada (QIASymphony). A técnica principal para o preparo da biblioteca de DNA é utilizando-se a tecnologia de PCR multiplexado com molecular barcode (QiaSeqDNA V3). Caso existam regiões não adequadamente cobertas na primeira técnica, é preparada por PCR convencional seguido de Nextera ou Sanger. O sequenciamento de segunda geração é realizado na plataforma Illumina e o sequenciamento de Sanger é realizado em um sequenciador automático ABI 3500. O resultado final é uma cobertura de 100% das bases com profundidade acima de 50x nos exons e 5pb de região intrônica adjacente. A chamada de variante é feita através do transcrito de referência a partir da base A do códon de iniciação ATG alinhado contra o genoma de referência GRCh37/hg19. Adicionalmente é realizada a PCR seguida de eletroforese em gel de agarose do exon 3 de BRCA2 para pesquisa da inserção ALU.
Limitações do exame
- Este teste detecta pequenas deleções e duplicações até 17 bp, mas grandes deleções e duplicações não são detectadas por esta metodologia. Outras alterações estruturais,como inversões e translocações também não são detectadas. Havendo suspeita de algumas destas alterações, pode-se usar metodologias como array CGH, MLPA, qPCR ou FISH. - Mutações por expansão de repeats de trinucleotídeos não são detectáveis por sequenciamento. - Mutações intrônicas profundas, mitocondriais ou em regiões regulatórias, como promotores, não são detectáveis no presente teste. - Alteração epigenéticas não são detectáveis por este teste.
Outros nomes para SEQUENCIAMENTO DOS GENES BRCA1 E BRCA2
- BRCA
- BRCA2 EXON 3 ALU
- Câncer de Mama
- Câncer de Ovário
- genes BRCA1 e BRCA2
- PAINEL GENÉTICO